科學(xué)家從糞便提取DNA鑒定出三種新種瀕危葉猴
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居住在新加坡的家從印尼葉猴。照片來(lái)源：維基百科／Andie Ang（CC BY-SA 4.0）
（神秘的糞便地球uux.cn報(bào)道）據(jù)環(huán)境資訊中心（姜唯 編譯 林大利 審校）：近期研究發(fā)現(xiàn)，近幾十年的定出保育工作成功使部分瀕危鳥(niǎo)類和哺乳動(dòng)物物種免于滅絕。但是種新種瀕，許多資料不足的危葉物種和亞種的個(gè)體數(shù)量仍不斷減少，此外，科學(xué)如果一個(gè)物種從未被發(fā)現(xiàn)，家從則無(wú)從保育。糞便
專家利用糞便分析 成功確認(rèn)出三種新種葉猴
「我們對(duì)許多物種一無(wú)所知。定出要保護(hù)物種，種新種瀕必須了解它們的危葉棲息地、食性偏好、科學(xué)遺傳多樣性和族群健全狀況等。家從」新加坡國(guó)立大學(xué)教授魯?shù)婪颍~爾（Rudolf Meier）說(shuō)。糞便
雖然DNA條碼逐漸成為鑒定物種的重要工具，但收集DNA最理想的方式，各家看法不同。
其中一個(gè)可能性是動(dòng)物糞便。 「過(guò)去我們得花兩到三年的時(shí)間進(jìn)行田野調(diào)查，收集關(guān)于一物種的最基本資訊，」邁爾說(shuō)，「現(xiàn)在透過(guò)糞便分析可以快速搜集到這些資料。不僅能夠獲得糞便主人的DNA，還能了解其飲食習(xí)慣、腸道菌相和寄生蟲量。」
英國(guó)衛(wèi)報(bào)報(bào)導(dǎo)，邁爾和新加坡、印尼和英國(guó)的同事利用糞便分析確認(rèn)了三種新種的葉猴。
萊氏葉猴（Presbytis femoralis）和東蘇門答臘葉猴（Presbytis percura）以前被認(rèn)為是印尼葉猴（Presbytis femoralis）的亞種。但現(xiàn)在已經(jīng)確認(rèn)這兩種東南亞靈長(zhǎng)類動(dòng)物本身就屬于獨(dú)立的物種，因此根據(jù)世界自然保育聯(lián)盟紅皮書的評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)，它們的受脅風(fēng)險(xiǎn)屬于「極度瀕危級(jí)」。該研究團(tuán)隊(duì)確認(rèn)的第三個(gè)種羅氏葉猴（Presbytis robinsoni）則為「近危級(jí)」。
這三種葉猴都是黑色，僅臉部、四肢和腹部的白色斑紋略有不同，長(zhǎng)期以來(lái)被認(rèn)為是一種分布廣泛的物種。它們?cè)谏掷锖苌俾涞兀院π摺㈦y以監(jiān)測(cè)和拍攝。
糞便分析能在不打擾動(dòng)物的情況下 完成物種資料收集
邁爾的研究《糞便DNA與物種救援》道出收集稀有物種資料的困難，因?yàn)椤盖秩胄圆蓸訋缀跏遣豢赡艿娜蝿?wù)」。
「其他DNA來(lái)源只有三種。首先是博物館標(biāo)本，但博物館中的標(biāo)本數(shù)量往往很少，許多標(biāo)本是在19世紀(jì)或20世紀(jì)初采集的，因此反映了在棲地大幅流失之前的歷史遺傳多樣性。第二種是從「意外死亡」（如路殺）的標(biāo)本中獲得的組織樣本。第三個(gè)來(lái)源是非侵入性樣本，如毛發(fā)和糞便。 」
糞便樣本可以在例行野外調(diào)查時(shí)收集，但這并非易事。戶外條件有時(shí)很惡劣，需要長(zhǎng)時(shí)間監(jiān)控。為了確保動(dòng)物不會(huì)感到被威脅，研究人員必須等待個(gè)體排便后離開(kāi)，才能接近糞便。
該論文的共同作者之一、野生動(dòng)物保護(hù)區(qū)新加坡保育基金會(huì)研究科學(xué)家安迪．昂（Andie Ang）說(shuō)：「土壤中的葉猴糞便很難辨識(shí)，因?yàn)轭伾蠖嘁彩亲厣Ｓ袝r(shí)葉猴糞便落下后撞到樹(shù)枝或樹(shù)葉，散在整片森林地面上，我們只能尋找非常小的碎片。」
「有時(shí)候糞便的氣味夠明顯，有時(shí)可以跟著蒼蠅或蜣螂的蹤跡。」
收集糞便樣本的好處是無(wú)非侵入性且不需要捕捉動(dòng)物。與采血或使用耳夾不同，它不會(huì)干擾或壓迫動(dòng)物。
過(guò)去由于缺乏資訊 數(shù)種瀕危葉猴未受保護(hù)
該研究使用市售試劑盒從葉猴糞便樣本中提取DNA，送至外部機(jī)構(gòu)進(jìn)行定序。定序結(jié)果包含少量葉猴本身的DNA、它吃下的食物的DNA、寄生蟲DNA，絕大多數(shù)是細(xì)菌的DNA。
另一位共同作者、新加坡國(guó)立大學(xué)研究員斯理法桑（Amrita Srivathsan）說(shuō)：「我們用生物資訊學(xué)技術(shù)分離葉猴DNA序列，并從中重建了完整的粒線體基因組。」
「發(fā)現(xiàn)三種葉猴的心情很復(fù)雜。它們的族群很小且零散，這很令人擔(dān)憂。但是至少現(xiàn)在它們可以被關(guān)注和保育……糞便分析提供的資訊對(duì)于理解物種的生態(tài)非常重要，有助于制定量身訂做的保育策略。」
在新加坡，只有60只印尼葉猴棲息在一處管制森林地，而在馬來(lái)西亞南部半島柔佛海峽，由于棕櫚油田迅速增加，個(gè)體數(shù)也在減少（250至300只）。
在印尼廖內(nèi)省發(fā)現(xiàn)的東蘇門答臘葉猴，大部分棲息地已被伐木和私人人工林所破壞。剩小群的東蘇門答臘葉猴散布在傳統(tǒng)橡膠園中，因?yàn)檫@些橡膠園仍然有一些天然植被。共同作者、西蘇門答臘安達(dá)拉斯大學(xué)的靈長(zhǎng)類動(dòng)物學(xué)家里扎爾迪（Rizaldi）說(shuō)：「由于缺少關(guān)于該物種的資料，它在印尼不被視為受保育的靈長(zhǎng)類。我們的論文是讓它受到保護(hù)的關(guān)鍵第一步。」
參考資料：《衛(wèi)報(bào)》（2020年11月5日），Scatological science: how poo analysis could help save endangered species
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